Die Wirkung von Soja auf die Gesundheit wird immer wieder kontrovers diskutiert. Im Oktober 1999 veröffentlichte z. B. die US-amerikanische Gesundheitsbehörde eine Studie, die Soja einen gesundheitlichen Benefit auf das kardiovaskuläre System zusprach. Eine von der Agency for Healthcare Research and Quality durchgeführte Metaanalyse kam nun allerdings zu einem anderen Ergebnis, in ihr konnte keine signifikante Verbesserung der Gesundheit durch Soja festgestellt werden.